Sam budynek został wniesiony w XVIII w. poza murami ówczesnego miasta, na terenie największej i najstarszej jurydyki krakowskiej zwanej Garbary (lub Piasek). Na przestrzeni minionych lat pełnił różne funkcje. Po 1945 r. został przejęty przez MNK i pełnił funkcję magazynu dzieł sztuki. Z kolei w latach 2013-2021 był siedzibą Ośrodka Kultury Europejskiej "Europeum".

    Na parterze w Muzeum Stanisława Wyspiańskiego można zobaczyć w ramach ekspozycji „We własnym domu” m.in. autoportrety Wyspiańskiego uzupełnione o wizerunki najbliższej rodziny, a także portrety przyjaciół, mecenasów oraz bliskich znajomych. Uzupełnieniem tej części wystawy są przedstawienia miejsc, w których Stanisław Wyspiański żył i tworzył, zarówno te krakowskie, jak i paryskie.

    Z kolei na pierwszym piętrze prezentowane są dzieła zgromadzone w 3 częściach: "Żywioły", "Wawel - dramat królów" i "Apollo-Chrystus". Jak podkreślają twórcy wystawy : „Wokół nich zbudowana została opowieść o artyście, który w swojej twórczości w nowatorski sposób podejmował problematykę narodową i religijną, odnosił się do pamięci i historii, inspirował antykiem i średniowieczem.

    Natomiast w podziemiu budynku, w sali „Księgi moje", jest prezentowany księgozbiór Wyspiańskiego z jego odręcznymi notatkami oraz pierwodruki wydań dramatów i utworów innych autorów, do których twórca wykonał okładki i ilustracje. Tam również znajdują się książki z dedykacjami współczesnych Wyspiańskiemu autorów. W drugiej Sali, nazwanej "Metamorfozy", zwiedzający mogą poznać twórczość teatralną autora „Wesela”, w tym m.in. plakatami do sztuk, wybranymi zdjęciami i fragmentami filmów z najsłynniejszych inscenizacji oraz ekranizacji dzieł literackich twórcy. Ponadto można też skorzystać z udostępnionego online katalogu zgromadzonych w MNK dzieł artysty.

    Muzeum Narodowego w Krakowie posiada największą i najcenniejszą, liczącą ponad tysiąc obiektów, kolekcję prac autora witraża "Bóg Ojciec, Stań się!". W otwartym muzeum zaprezentowano ponad 200 prac. Jednak organizatorzy zapewniają, że ekspozycja będzie zmieniana co roku.